389 पेपर
यह शोध पत्र प्रस्तावित करता है कि आधुनिक जेनेटिक कोड का विकास एक आदिम कॉमा-मुक्त (comma-free) उपकोड से हुआ है, जो "संगत कॉमा-मुक्त कोड्स" की अवधारणा का उपयोग करता है ताकि यह समझाया जा सके कि कैसे कोड के विकास को स्थिर किए बिना एक डबलट-से-ट्रिपलेट संक्रमण घटित हो सकता था, एक ऐसी परिकल्पना जिसे आधुनिक वोबल नियमों (wobble rules) के अनुरूप अनुकूलतम उम्मीदवारों की पहचान द्वारा समर्थन प्राप्त है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि हाइड्रोज़ोअन में एलोरिकग्निशन जीन कॉम्प्लेक्स (ARC), प्रमुख निडेरियन वंशों में संरचनात्मक और सिनटेनिक रूप से संरक्षित है, जो इस बात का प्रमाण प्रदान करता है कि यह प्रणाली निडेरियन के विचलन से पूर्व की है और वर्टिब्रेट मेजर हिस्टोकम्पैटिबिलिटी कॉम्प्लेक्स (MHC) के समरूप हो सकती है।
एक गतिशील प्रणालियों (dynamical systems) के ढांचे का उपयोग करते हुए, यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि फागोसाइटोसिस (phagocytosis) एक सहकारी सूक्ष्मजीव समुदाय से विकसित हो सकता है और अपने मूल सदस्यों के साथ सह-अस्तित्व में रह सकता है, जो अंततः दो सहयोगियों और एक शुद्ध शिकारी वाले एक स्थिर पारिस्थितिकी तंत्र की ओर ले जाता है।
यह अध्ययन कोरलिमॉर्फेरियन *रिकॉर्डिया युमा* (Ricordea yuma) के गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम का उपयोग करके स्टोनी कोरल के सिस्टर ग्रुप के रूप में इसकी स्थिति की पुष्टि करता है, जिससे यह पता चलता है कि कोरल कैल्सीफिकेशन एक विशिष्ट कैलिकोब्लास्ट सेल अवस्था के उद्भव और वंश-विशिष्ट नवाचारों एवं सह-विकल्पित पूर्वज जीन दोनों से निर्मित बायोमिनरलाइजेशन टूलकिट के संयोजन के माध्यम से विकसित हुआ।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मानव PKR की eIF2-बाइंडिंग सतह अत्यधिक लचीली है, जो आनुवंशिक वेरिएंट्स को प्रोटीन कार्य बनाए रखते हुए और नई कमजोरियों से बचते हुए, सामान्य विशेषताओं का लाभ उठाकर विविध प्रकार के वायरल स्यूडोसबस्ट्रेट अवरोधकों से व्यापक रूप से बचने की अनुमति देती है।
EXCON एक स्केलेबल, ऑटोमेटेड Nextflow पाइपलाइन है जो CAFE-आधारित जीन फैमिली एक्सपेंशन और कॉन्ट्रैक्शन विश्लेषण के संपूर्ण वर्कफ़्लो को सुव्यवस्थित करता है—जीनोम प्रीप्रोसेसिंग और ऑर्थोलॉग पहचान से लेकर बर्थ-डेथ मॉडलिंग और फंक्शनल एनरिचमेंट तक—जो न्यूनतम उपयोगकर्ता कॉन्फ़िगरेशन के साथ पुनरुत्पादनीय (reproducible) इवोल्यूशनरी कम्पैरेटिव जीनोमिक्स को सक्षम बनाता है।
यह अध्ययन कुनमिंग-मॉन्ट्रियल ग्लोबल बायोडायवर्सिटी फ्रेमवर्क के जेनेटिक डायवर्सिटी संकेतकों के मैक्सिको के प्रारंभिक अनुप्रयोग का मूल्यांकन करता है, जिससे यह पता चलता है कि जबकि ये मीट्रिक्स गैर-खतरे वाली प्रजातियों और फसल जंगली रिश्तेदारों में छिपी आनुवंशिक कमजोरियों को उजागर करते हैं, इस तरह की निगरानी को व्यापक बनाने के लिए प्राथमिक चुनौती केवल नया डेटा उत्पन्न करने के बजाय शोधकर्ताओं, समुदायों और सरकारी संस्थानों के बीच सहयोग को बढ़ावा देने के लिए मौजूदा डेटा को एकीकृत करने में निहित है।
यह शोध पत्र एक स्टोकेस्टिक सिमुलेशन फ्रेमवर्क को एप्रोक्सिमेट बेयसियन कम्प्यूटेशन के साथ जोड़कर पेश करता है ताकि उन जटिल परिदृश्यों में बैक्टीरिया के उत्परिवर्तन दरों (म्यूटेशन रेट्स) और फिटनेस प्रभावों का सटीक अनुमान लगाया जा सके जहाँ कोशिका मृत्यु और परिवर्तनशील विकास दर जैसी प्रतिबंधात्मक धारणाओं के कारण पारंपरिक गणितीय मॉडल विफल हो जाते हैं।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि सेब के पालतूकरण ने रक्षा-संबद्ध नियामक नेटवर्क को नया रूप दिया और एफिड्स (aphids) के लिए अनुकूलन परिदृश्य को संशोधित किया, जिसके परिणामस्वरूप जंगली रिश्तेदारों की तुलना में, जो अधिक निरंतर प्रतिरोध (constitutive resistance) पर निर्भर करते हैं, संवर्धित सेबों में मजबूत प्रेरणीय रक्षा (inducible defenses) है लेकिन वे उच्च एफिड प्रदर्शन का समर्थन करते हैं।
यह अध्ययन बडिंग यीस्ट (budding yeast) के सैद्धांतिक मॉडलों और प्रयोगात्मक डेटा को एकीकृत करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि व्यापक यादृच्छिक एपिस्टेसिस (random epistasis) क्रॉस-एनवायरनमेंट प्लियोट्रॉपी (cross-environment pleiotropy) के व्यवस्थित पैटर्न उत्पन्न कर सकता है, जिससे उतार-चढ़ाव वाले वातावरण में दीर्घकालिक विकासवादी ट्रेड-ऑफ (evolutionary tradeoffs) आकार लेते हैं।